Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms