Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP1Q9C000 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms