Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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