Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS3Q9BZE2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms