Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SALL3Q9BXA9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SALL3Q9BXA9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms