Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAF4Q9BUZ4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAF4Q9BUZ4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms