Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms