Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR3CQ9BUI4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms