Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms