Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms