Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYD88Q99836 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms