Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms