Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIN3AQ96ST3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms