Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms