Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLIN4Q96Q06 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms