Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMTK3Q96Q04 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms