Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF4Q96M43 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF4Q96M43 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms