Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM47Q96LD4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms