Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCZQ96LD1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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