Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRIQ1Q96JM4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
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