Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms