Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDC3Q96F86 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDC3Q96F86 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms