Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MFSD3Q96ES6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms