Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC1Q96C34 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms