Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms