Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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GTF3C6Q969F1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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GTF3C6Q969F1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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GTF3C6Q969F1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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GTF3C6Q969F1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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GTF3C6Q969F1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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GTF3C6Q969F1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
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