Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATAD2BQ8WXI9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms