Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL11Q8NHH1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms