Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNBD1Q8NA66 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNBD1Q8NA66 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms