Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms