Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAG1Q86YV5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms