Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC84Q86UT8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC84Q86UT8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms