Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYT9Q86SS6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms