Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R42Q7Z4L9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R42Q7Z4L9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R42Q7Z4L9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms