Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms