Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRINP3Q76B58 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRINP3Q76B58 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms