Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms