Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00299Q6ZSB3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms