Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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C9orf47Q6ZRZ4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf47Q6ZRZ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf47Q6ZRZ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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