Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC129Q6ZRS4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms