Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC73Q6ZRK6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC73Q6ZRK6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms