Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TREML4Q6UXN2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms