Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms