Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms