Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNP1Q6NT89 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms