Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRT80Q6KB66 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms