Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD40Q6AI12 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD40Q6AI12 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms