Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM29Q5VYK3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms