Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GARNL3Q5VVW2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GARNL3Q5VVW2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms