Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf140Q5VVS0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf140Q5VVS0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf140Q5VVS0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf140Q5VVS0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf140Q5VVS0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms